ACTIVITES DE RECHERCHE

Mes recherches se focalisent sur le rôle de facteurs biotiques et abiotiques sur la distribution, l’émergence et la sévérité de maladies infectieuses émergentes. Mes projets couvrent plusieurs disciplines, dont l’écologie de maladies infectieuses et la pathologie végétale, et sont basés sur des approches expérimentales et de terrain. Mes activités incluent la mise en place des outils nécessaires pour l’étude d’interactions écologiques complexes, et visent la production de connaissances fondamentales et d’applications terrain via le transfert vers et la collaboration avec les professionnels de différentes filières de production.
L’objectif global de mes projets de recherche est de contribuer à une meilleure gestion et surveillance de maladies infectieuses émergentes de plantes. J’étudie pour cela deux systèmes biologiques correspondant à deux maladies au nom identique, i.e. la maladie du chancre bactérien, causée par des souches du complexe d’espèces Pseudomonas syringae à des arbres fruitiers (e.g. kiwi et abricot) et par des souches de Clavibacter michiganensis susbp. michiganensis (Cmm) en culture de tomate.

Les questions spécifiques que je traite concernent diverses échelles spatiales et ont pour objectifs :

I) Améliorer le diagnostic de la santé de plantes et l’étude de facteurs qui influencent la sévérité de maladies dans des contextes de multiples stress biotiques et abiotiques, et ce à l’échelle de la plante individuelle jusqu’au paysage

II) Mieux comprendre le rôle de plantes sauvages au sein de systèmes agricoles (i.e. couvre-sols de vergers) en tant que potentiels réservoirs de micro-organismes pathogènes

Couvre-sol entre deux rangs d’un verger de kiwis

III) Analyser la structure et la diversité de populations de micro-organismes de plantes au sein de divers substrats et contextes (e.g. échantillons de plantes au sein de vergers, et d’eaux de rivières qui constituent un vecteur de dissémination)

IV) Concevoir des outils innovants de détection de micro-organismes pathogènes de plantes utilisables sur le terrain au sein de stratégies de lutte intégrée.